Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms