Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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