Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSTF3Q12996 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms