Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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GTF3C1Q12789 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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GTF3C1Q12789 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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GTF3C1Q12789 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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GTF3C1Q12789 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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GTF3C1Q12789 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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GTF3C1Q12789 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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