Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAPQ12770 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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