Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms