Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms