Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms