Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms