Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEX3Q00994 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms