Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms