Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms