Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms