Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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