Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO4P61968 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO4P61968 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO4P61968 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO4P61968 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO4P61968 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO4P61968 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms