Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND3P61587 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND3P61587 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RND3P61587 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RND3P61587 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RND3P61587 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RND3P61587 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RND3P61587 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RND3P61587 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RND3P61587 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RND3P61587 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RND3P61587 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RND3P61587 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RND3P61587 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RND3P61587 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RND3P61587 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms