Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms