Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA1P56159 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms