Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFDNP55196 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFDNP55196 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFDNP55196 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFDNP55196 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFDNP55196 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFDNP55196 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFDNP55196 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFDNP55196 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFDNP55196 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFDNP55196 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFDNP55196 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFDNP55196 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AFDNP55196 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFDNP55196 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AFDNP55196 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFDNP55196 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFDNP55196 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFDNP55196 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFDNP55196 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFDNP55196 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFDNP55196 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFDNP55196 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AFDNP55196 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFDNP55196 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFDNP55196 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFDNP55196 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFDNP55196 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFDNP55196 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFDNP55196 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFDNP55196 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFDNP55196 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms