Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF6P49848 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TAF6P49848 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TAF6P49848 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TAF6P49848 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF6P49848 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF6P49848 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF6P49848 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF6P49848 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF6P49848 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF6P49848 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF6P49848 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF6P49848 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF6P49848 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF6P49848 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF6P49848 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF6P49848 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF6P49848 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF6P49848 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF6P49848 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF6P49848 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF6P49848 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF6P49848 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF6P49848 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF6P49848 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF6P49848 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF6P49848 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF6P49848 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF6P49848 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF6P49848 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF6P49848 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF6P49848 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms