Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms