Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTPAP49638 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTPAP49638 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTPAP49638 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTPAP49638 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTPAP49638 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTPAP49638 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTPAP49638 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTPAP49638 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTPAP49638 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTPAP49638 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTPAP49638 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTPAP49638 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTPAP49638 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTPAP49638 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTPAP49638 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTPAP49638 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTPAP49638 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTPAP49638 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTPAP49638 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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