Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIP4K2AP48426 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms