Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms