Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME1P48163 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ME1P48163 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME1P48163 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ME1P48163 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME1P48163 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME1P48163 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME1P48163 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME1P48163 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME1P48163 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME1P48163 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME1P48163 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ME1P48163 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ME1P48163 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME1P48163 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME1P48163 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME1P48163 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME1P48163 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME1P48163 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME1P48163 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME1P48163 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME1P48163 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME1P48163 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME1P48163 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME1P48163 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME1P48163 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ME1P48163 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ME1P48163 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME1P48163 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME1P48163 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ME1P48163 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME1P48163 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms