Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms