Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL3P36405 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms