Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ALDH4A1P30038 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALDH4A1P30038 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms