Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
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