Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PEX2P28328 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PEX2P28328 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX2P28328 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX2P28328 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX2P28328 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms