Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPREP23469 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPREP23469 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPREP23469 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPREP23469 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPREP23469 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPREP23469 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPREP23469 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPREP23469 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPREP23469 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPREP23469 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPREP23469 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPREP23469 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPREP23469 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPREP23469 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPREP23469 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPREP23469 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPREP23469 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPREP23469 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPREP23469 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPREP23469 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPREP23469 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPREP23469 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPREP23469 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPREP23469 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPREP23469 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPREP23469 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPREP23469 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms