Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms