Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSPP15924 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSPP15924 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSPP15924 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSPP15924 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSPP15924 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSPP15924 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSPP15924 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms