Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms