Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC130P13994 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC130P13994 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms