Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFTRP13569 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CFTRP13569 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CFTRP13569 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CFTRP13569 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CFTRP13569 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CFTRP13569 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFTRP13569 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFTRP13569 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFTRP13569 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFTRP13569 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFTRP13569 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFTRP13569 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFTRP13569 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFTRP13569 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFTRP13569 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFTRP13569 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFTRP13569 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFTRP13569 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFTRP13569 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFTRP13569 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFTRP13569 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFTRP13569 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFTRP13569 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFTRP13569 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFTRP13569 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFTRP13569 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CFTRP13569 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFTRP13569 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFTRP13569 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFTRP13569 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFTRP13569 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFTRP13569 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFTRP13569 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFTRP13569 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFTRP13569 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CFTRP13569 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFTRP13569 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFTRP13569 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFTRP13569 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFTRP13569 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFTRP13569 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFTRP13569 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFTRP13569 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFTRP13569 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFTRP13569 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFTRP13569 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFTRP13569 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFTRP13569 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFTRP13569 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFTRP13569 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CFTRP13569 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFTRP13569 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CFTRP13569 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CFTRP13569 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CFTRP13569 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CFTRP13569 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CFTRP13569 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CFTRP13569 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CFTRP13569 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CFTRP13569 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CFTRP13569 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFTRP13569 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFTRP13569 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFTRP13569 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFTRP13569 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFTRP13569 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFTRP13569 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFTRP13569 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFTRP13569 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFTRP13569 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFTRP13569 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CFTRP13569 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFTRP13569 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFTRP13569 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFTRP13569 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFTRP13569 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFTRP13569 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFTRP13569 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFTRP13569 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CFTRP13569 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFTRP13569 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFTRP13569 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFTRP13569 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFTRP13569 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms