Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN1P12814 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms