Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRP12270 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRP12270 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRP12270 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRP12270 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRP12270 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRP12270 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRP12270 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRP12270 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRP12270 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRP12270 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRP12270 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRP12270 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRP12270 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRP12270 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRP12270 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRP12270 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRP12270 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRP12270 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRP12270 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms