Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3P10147 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCL3P10147 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCL3P10147 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCL3P10147 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCL3P10147 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCL3P10147 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3P10147 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3P10147 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCL3P10147 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms