Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI3P10071 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI3P10071 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI3P10071 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI3P10071 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI3P10071 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI3P10071 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GLI3P10071 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI3P10071 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI3P10071 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI3P10071 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI3P10071 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI3P10071 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI3P10071 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI3P10071 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI3P10071 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI3P10071 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI3P10071 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI3P10071 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI3P10071 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI3P10071 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI3P10071 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI3P10071 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI3P10071 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI3P10071 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI3P10071 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms