Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIL1P09327 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIL1P09327 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIL1P09327 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIL1P09327 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VIL1P09327 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIL1P09327 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIL1P09327 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIL1P09327 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIL1P09327 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIL1P09327 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIL1P09327 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIL1P09327 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIL1P09327 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIL1P09327 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIL1P09327 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIL1P09327 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIL1P09327 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIL1P09327 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIL1P09327 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIL1P09327 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VIL1P09327 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIL1P09327 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIL1P09327 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VIL1P09327 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIL1P09327 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
VIL1P09327 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIL1P09327 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIL1P09327 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIL1P09327 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIL1P09327 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIL1P09327 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIL1P09327 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIL1P09327 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIL1P09327 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIL1P09327 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIL1P09327 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIL1P09327 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIL1P09327 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIL1P09327 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIL1P09327 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIL1P09327 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIL1P09327 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIL1P09327 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VIL1P09327 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms