Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB1P08034 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB1P08034 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB1P08034 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB1P08034 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms