Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNKO75909 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNKO75909 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNKO75909 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNKO75909 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNKO75909 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNKO75909 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNKO75909 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNKO75909 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNKO75909 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNKO75909 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNKO75909 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCNKO75909 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCNKO75909 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCNKO75909 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCNKO75909 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNKO75909 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNKO75909 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNKO75909 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNKO75909 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNKO75909 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNKO75909 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNKO75909 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNKO75909 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNKO75909 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNKO75909 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNKO75909 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNKO75909 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNKO75909 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms