Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VAMP4O75379 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms