Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND1O60716 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms