Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSPNO60542 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPNO60542 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPNO60542 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSPNO60542 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSPNO60542 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSPNO60542 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSPNO60542 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSPNO60542 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSPNO60542 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms