Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPAG9O60271 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPAG9O60271 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms