Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA2O43921 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms