Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCO2O43819 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCO2O43819 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCO2O43819 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCO2O43819 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCO2O43819 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms