Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms